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编号:667490
黑色素瘤细胞PRDM1对增殖、凋亡和迁移的影响
http://www.100md.com 2023年1月31日 中国现代医生 2022年第36期
孵育,数据库,1基因表达谱数据动态分析(geneexpressionprofilinginteractiveanalysis,GEPIA),2细胞和主要试剂,3细胞培养和转染,4实时荧光定量PCR检测,5流式细胞
     陈 婷 苏文杨 朱希聪

    ·论 著·

    黑色素瘤细胞PRDM1对增殖、凋亡和迁移的影响

    陈 婷1苏文杨2朱希聪1

    1.浙江省台州医院皮肤科,浙江台州 317000;2.浙江省台州医院神经内科,浙江台州 317000

    探讨含PR/SET域蛋白1(PR/SET domain 1,PRDM1)表达水平与黑色素瘤患者预后的关系,及对黑色素瘤细胞增殖、凋亡、迁移的影响。分别通过基因表达谱数据动态分析(gene expression profiling interactive analysis,GEPIA)数据库和基因集变异分析(gene seb camcer analysis,GSCA)数据库分析PRDM1在皮肤黑色素瘤和正常组织中的表达差异及其与预后的关系。在细胞水平上将黑色素瘤A375分为两组,分别为转染siRNA-PRDM1和空载对照siRNA-NC,流式细胞仪检测各组黑色素瘤A375细胞的增殖能力、抗凋亡能力,Transwell小室检测各组黑色素瘤A375细胞的迁移能力,Western blot法检测各组黑色素瘤A375细胞中MYC的表达水平。与正常组织比较,PRDM1在黑色素瘤中低表达,且黑色素瘤患者中PRDM1高表达者预后较低表达者好。在黑色素瘤A375细胞中PRDM1低表达后细胞的增殖、迁移能力增强,而抗凋亡能力下降,且细胞中MYC蛋白表达水平上调(1 材料与方法

    1.1 基因表达谱数据动态分析(gene expression profiling interactive analysis,GEPIA)

    将TCGA与GTEx数据库中肿瘤和正常组织样本数据整合后进行基因分析表达的可视化数据库,涵盖了9736个肿瘤组织和8587个正常组织的RNA数据[10]。利用GEPIA数据库分析PRDM1基因在皮肤黑色素瘤中的表达情况。

    1.2 细胞和主要试剂

    人黑色素瘤细胞株A375(美国模式培养物集存库ATCC),DMEM培养基、Transwell小室(美国Corning公司),胎牛血清、1%青霉素-链霉素(美国Thermo Fisher公司),Lipofectamine 2000(美国Invitrogen公司),Trizol、反转录试剂盒、SYBR Green(日本TaKaRa公司),EdU试剂盒、siRNA-PRDM1及siRNA-NC(广州锐博生物技术有限公司),RNase A、凋亡试剂盒购(南京凯基生物有限公司),PRDM1、MYC、GAPDH单克隆抗体(中国爱博泰克生物公司 ......

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