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编号:666992
基于生物信息学分析艾叶治疗慢性荨麻疹的分子机制
http://www.100md.com 2023年7月4日 中国现代医生 2023年第15期
     种凯艳 兰祝飚

    [摘要]?目的?運用基因表达数据库(Gene?Expression?Omnibus,GEO)基因芯片挖掘、生物信息学及分子对接技术,分析艾叶治疗慢性荨麻疹(chronic?urticaria,CU)的分子机制。方法?从GEO数据库下载CU的基因芯片数据集,利用R软件筛选出差异表达靶点,从中药系统药理学数据库(Traditional?Chinese?Medicine?Systems?Pharmacology?Database,TCMSP)、药物靶标识别平台(Pharm?Mapper)等数据库获取艾叶的化学成分、药物靶点,运用GENEMANIA平台及R软件,对药物–疾病交集靶点进行蛋白质互作网络(protein-protein?interaction?networks,PPI)分析、京都基因与基因组百科全书(Kyoto?Encyclopedia?of?Genes?and?Genome,KEGG)富集分析,使用AutoDock?Vina等软件进行分子对接验证。结果?得到CU靶点320个、药物靶点382个,筛选出药物–疾病交集靶点20个;PPI拓扑分析得出的核心靶点有ADAMTS4、FABP7、SRM、PDE5A、SOD2等;相关的化学成分有(2R)-5,7-二羟基-2-(4-羟苯基)、亚油酸乙酯、豆甾醇、槲皮素等;富集出涉及脂质和动脉粥样硬化、长寿调节信号通路、过氧化物酶体增殖活化因子受体(peroxisome?proliferator-activated?receptor,PPAR)信号通路、白细胞介素(interleukin,IL)-17信号通路、趋化因子信号通路等;9种化学成分与5个核心靶点间的分子对接显示,有40组对接具有结合活性(结合能

    慢性荨麻疹(chronic?urticaria,CU)是一种常见的皮肤过敏性疾病 ......

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