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编号:666316
基于新抗原筛选的肿瘤疫苗改造策略研究进展
http://www.100md.com 2024年1月8日 中国现代医生 2023年第36期
免疫原性,表位,残基,1肿瘤新抗原的鉴定筛选技术,1外显子测序技术,2蛋白质谱技术,3T细胞测序技术,4计算机新抗原预测技术,2有效抗原表位的特征,1MHC限制性肽表位的残基特征,2肽表位的固有特性与HLA相互作用,3
     赵董丽,朱影,黄常新

    1.浙江中医药大学第四临床医学院,浙江杭州 310053;2.浙江中医药大学附属第一医院肿瘤科,浙江杭州 310000;3.杭州师范大学附属医院肿瘤科,浙江杭州 310000

    肿瘤细胞基因组突变可转录、翻译产生异常蛋白质,异常蛋白质酶解生成的异源性肽与正常细胞表达的氨基酸序列并不一致,其可被抗原提呈细胞中的主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex,MHC)所识别,MHC可将抗原肽提呈至抗原提呈细胞表面,供T细胞受体(T cell receptor,TCR)所识别和活化,最终激活细胞毒性T淋巴细胞(cytotoxic T lymphocyte,CTL)发挥特异性抗肿瘤免疫反应。自肿瘤特异性抗原、肿瘤相关抗原等相关研究开展至今,抗原的发现与抗原改造便如影随形,成为基于抗原肽抗肿瘤免疫治疗中最主要的两大问题。

    1 肿瘤新抗原的鉴定筛选技术

    肿瘤新抗原的体外筛选是将肿瘤组织全外显子测序、转录组测序、蛋白质谱、T细胞组库测序、计算机机器学习预测新抗原与体外实验等技术联合,鉴定具有抗肿瘤免疫效应的高效肿瘤新抗原,见图1。

    图1 肿瘤新抗原的体外筛选技术

    1.1 外显子测序技术

    研究人员使用高通量测序技术,将肿瘤细胞中的脱氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid,DNA)、核糖核酸(ribonucleic acid,RNA)与正常健康组织进行比较,找到肿瘤患者个体化的非同义突变,以预测肿瘤特异性新抗原。2017年,Sahin等[1]首次将个体化突变体疫苗应用于人体,通过外显子测序技术全面识别个体突变,设计和合成针对黑色素瘤患者的个体化肿瘤疫苗,结果发现所有接种该疫苗的受试者体内均产生强大且高效的特异性抗肿瘤T细胞应答,5例转移瘤患者中的2例患者表现出与疫苗相关的客观缓解,此研究开辟新抗原免疫治疗道路。

    外显子测序技术的测序数据量大、测序深度高,测序技术已较为成熟,检测到的突变基因较可靠,已在临床和科研中广泛应用。但RNA转录、蛋白质翻译修饰及后续酶解等一系列“黑箱”过程中的不可预知性也极大地制约其应用 ......

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