特发性非肝硬化门静脉高压症的关键基因通路筛选与潜在中药预测
刘玥佩 钟颖 张萍 杨冉潋 李雷益![](/images/paper/1673-9701/202402/12-1-l.jpg)
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[摘要]?目的?采用生物信息学方法对特发性非肝硬化门静脉高压症(idiopathic?non-cirrhotic?portal?hypertension,INCPH)的基因芯片数据进行分析,获取疾病发生发展的关键基因和信号通路,预测治疗INCPH的潜在中药。方法?从基因表达综合数据库(gene?expression?omnibus,GEO)数据库下载关于INCPH的基因芯片数据集GSE77627,利用R语言对数据进行标准化并筛选INCPH的差异基因(differential?genes,DEGs),并利用Metascape数据库对所有DEGs进行基因本体(gene?ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto?encyclopedia?of?genes?and?genomes,KEGG)富集分析,并通过STRING数据库构建蛋白-蛋白互作网络;同时,利用CytoHubba插件筛选Degree值排名前15的DEGs作为关键基因。随后将关键基因与医学本体信息检索平台互相映射,以P<0.05为标准筛选治疗INCPH的潜在中药 ......
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