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编号:478359
乙酰辅酶A羧化酶相关树突状细胞标记预测肝癌患者的预后及潜在治疗药物识别
http://www.100md.com 2024年3月8日 中国现代医生 2024年第5期
     闫长孟 韩君

    [摘要]?目的?研究乙酰輔酶A羧化酶(acetyl-coa?carboxylase?1,ACACA)基因在肝癌中的表达、预后价值及其与免疫细胞的相关性,构建肝癌预后模型。方法?整合基因型组织表达(genotype-tissue?expression,GTEx)数据库和癌症基因组图谱(The?Cancer?Genome?Atlas,TCGA)数据分析ACACA基因在癌症及癌旁组织的表达差异,预后分析。分析ACACA与免疫细胞的相关性。使用GSE156625单细胞转录组测序(single?cell?RNA?seq,scRNA-seq)数据研究ACACA在树突状细胞(dendritic?cells,DCs)中的表达。建立基于载脂蛋白C-Ⅰ(apolipoprotein?c-Ⅰ,APOC1)和载脂蛋白C-Ⅲ(apolipoprotein?c-Ⅲ,APOC3)的肝细胞癌(hepatocellular?carcinoma,HCC)预后模型,使用Kaplan-Meier生存曲线和时间依赖性受试者操作特征(receiver?operator?characteristic,ROC)曲线评估预后能力,并通过分子对接分析中药成分在APOC1和APOC3中的作用。结果?ACACA在多种癌症中表达差异显著,与肝癌预后相关。高表达ACACA降低树突状细胞含量。APOC1和APOC3是主要DCs标记基因,与ACACA表达正相关。基于APOC1和APOC3的原发性HCC预后模型具有中等的敏感性和特异性。使用列线图预测TCGA队列中肝癌患者的1年,3年和5年总生存期(overall?survival,OS)的可能性,并通过校准曲线分析证实了其可靠性。Salvianolic?acid?B、Asiaticoside和Neohesperidin可能对APOC1和APOC3具有作用潜力。结论?ACACA与肝癌预后密切相关,基于APOC1和APOC3的预后模型可作为预测指标,部分中药成分可能对肝癌治疗有潜力。

    [关键词]?肝癌;乙酰辅酶A羧化酶;预后;免疫细胞;DCs细胞标记基因

    [中图分类号]?R735.7?[文献标识码]?A ?[DOI]?10.3969/j.issn.1673-9701.2024.05.018

    Prediction?of?prognosis?and?identification?of?potential?therapeutic?agents?for?liver?cancer?patients?based?on?acetyl-coa?carboxylase?1-associated?dendritic?cell ......

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