基于iTRAQ标记技术研究慢性浅表性胃炎脾虚证的唾液差异表达蛋白
1资料与标准,2方法,3结果,4数据的生物信息解析,5讨论
贺佐梅,夏帅帅,邵 峰,吴华英,吴正治*,谢梦洲*(1.湖南中医药大学中医诊断研究所,湖南 长沙 410208;2.广东医学院附属福田医院,广东 深圳 518033;3.湖南省2011数字中医药协同创新中心,湖南 长沙 410208)
·基础研究·
基于iTRAQ标记技术研究慢性浅表性胃炎脾虚证的唾液差异表达蛋白
贺佐梅1,夏帅帅1,邵 峰1,吴华英1,吴正治2*,谢梦洲1*
(1.湖南中医药大学中医诊断研究所,湖南 长沙 410208;2.广东医学院附属福田医院,广东 深圳 518033;3.湖南省2011数字中医药协同创新中心,湖南 长沙 410208)
目的 运用iTRAQ定量蛋白质组学技术筛选慢性浅表性胃炎(chronic superficial gastritis,CSG)不同中医证候患者唾液中的潜在特异性生物标志物,探索一种客观化、规范化的中医辨证方法。方法 采用iTRAQ定量蛋白质组学技术及后期生物信息学方法,筛选CSG脾虚证28例与CSG湿热证28例对比以及与正常对照组28例对比的唾液差异蛋白质分析。结果 CSG脾虚证对比CSG湿热证,Ratio≥1.5的共有128个蛋白,Ratio≤0.667的共有39个蛋白;CSG脾虚证对比正常对照组Ratio≥1.5的共有113个蛋白,Ratio≤0.667的共有72个蛋白。筛选出多个重要蛋白,如Keratin家族、ANX家族和apolipoprotein家族中的多种亚型以及γ-谷氨酸转移酶等,可能与CSG不同中医证候的发生、发展有密切的关系。结论 iTRAQ唾液蛋白质组技术筛选出了多个具有潜在价值的CSG中医证候无创诊断的重要蛋白,值得进一步深入研究。
慢性浅表性胃炎;中医证候;脾虚证;湿热证;分子诊断;唾液;定量蛋白质组学;iTRAQ
中医药对于慢性胃炎的治疗有独特的优势,但是往往难于准确把握证型。本文采用现代系统生物学方法——同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantitation,iTRAQ)定量蛋白质组学技术研究慢性胃炎证型[1],以慢性浅表性胃炎(chronic superficial gastritis,CSG)为代表,进行胃炎中医辨证客观化、规范化的初步探索。CSG病因有虚实二因,本研究选取虚证(以脾胃气虚证为代表)、实证(以湿热蕴脾证为代表)CSG患者的唾液标本进行研究。
本研究是基于iTRAQ及液相-质谱/质谱联用(liquid chromatography coupled with tandem mass spectrometry ......
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