基于测序技术探究卡介菌生物制剂核酸物质基础(4)
2.4.2 注射液核酸CpG基序保留情況及分布分析 进一步对注射液核酸中保留的4种CpG基序进行分析,分别以10 000和100 000为间距进行统计分析,如图5,发现产品核酸中保留了大量的CpG基序,除少数几个显著升高的区域,在全基因组中分布也较为平均。从出现频次可以看出,在282个全基因组数据中保留了1 085 216次,相当于每个卡介菌中保留了3 848次,该数据略高于从全基因组分析得到的3 631次,说明注射液产品中核酸物质活性基序得到一定程度的富集。进一步对4种CpG基序出现频次比较,四种基序出现概率分别为GACGTT和GTCGTT各占37%、AACGTT占12%、TTCGTT占14%,与从全基因组分析得到的结果几乎一致。其中,CpG基序中的GACGTT基序在整个产品核酸中出现频次最高,且在部分区域表现出显著升高,最高可达到4 247/1.0×105次碱基 ......
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