基于网络药理学探讨石菖蒲有效成分治疗神经退行性疾病的研究
靶点,受体,1材料与方法,1石菖蒲主要有效成分与靶点收集,2神经退行性疾病靶点的收集,3蛋白互作网络图构建,4GO功能分析和KEGG通路富集分析,2结果,1石菖蒲有效成分及靶点,2神经退行性疾病相关靶点
王志芳 潘琪 张宾 徐展琼 方永奇 王南卜神经退行性疾病(neurodegenerative diseases,ND)是一类由于大脑和脊髓的神经元细胞变性、丢失而引起的一类不可逆转的神经系统疾病,以发作迟缓和选择性神经元的功能障碍为特征,主要包括阿尔茨海默症(alzheimer disease,AD)、帕金森氏病(parkinson’s disease,PD)和肌萎缩性侧索硬化(amyotrophic lateral sclerosis,ALS)[1]。现在对于ND以药物治疗为主,如多奈哌齐改善AD患者的认知功能[2];左旋多巴缓解PD运动功能障碍等[3]。天南星科植物的干燥根茎石菖蒲已经被证实对ND相关疾病具有缓解作用。石菖蒲及其挥发油对AD[4-6]和PD[7-8]模型动物都具有缓解症状改善病理状态的作用,通过分析石菖蒲中何种成分对ND的治疗发挥主要作用有助于推动石菖蒲治疗ND的机制研究。
本研究通过网络药理学原理筛选出石菖蒲治疗ND的主要靶点,结合已发现的石菖蒲中挥发油类物质是开窍醒神作用的主要有效成分[9]。探讨石菖蒲治疗ND的潜在分子机制与信号通路,为今后研究石菖蒲治疗ND提供更深层次的理论依据。
1 材料与方法
1.1 石菖蒲主要有效成分与靶点收集
以“Acorus tatarinowii Schott”为关键词,通过中药系统药理学TCMSP(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform)数据库(http:// ibts.hkbu.edu.hk/LSP/tcmsp.php)、Pubmed和中国知网已发表的文献收集石菖蒲的有效成分与靶点。并筛选出符合口服生物利用度(oral bioavailability,OB)≥30%,血脑屏障通透性(blood brain barrier,BBB)≥-0.3,类药性指数筛选(drug like index,DL)≥0.10条件的成分,导入TCMSP数据库获取相应靶点,并用Uniprot数据(https://www.uniprot.org/)以物种名称“Homo sapiens”为物种名称,筛选已经验证的靶点作为石菖蒲的有效成分或靶点 ......
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