基本药物的供应保障堪忧。

    实施集中招标采购后，部分药品招标结果中价格虚低、供应短缺等问题也开始出现。各省针对违约违规企业制定的黑名单，似乎也没有起到预期效果。河北、广东、江苏等省制定了低价或廉价药品目录，对目录中的低价药品实施价格保护。工信部于2012年底启动了基本药物部分短缺药品的定点生产工作。

    基本药物医保报销政策效果极小。

    医改的文件中要求，基本药物全部纳入医保药品报销目录，报销比例明显高于非基本药物。人保部将基本药物全部纳入2009年版医保药品目录甲类药品，全额给付，以示支持。但由于国家基本药物遴选时，原则上是从医保甲类药品遴选，医保起付线内的费用仍由患者自付，所以这一政策的实际效果极小。

    基层医疗卫生机构补偿远远不足。

    实施基本药物制度后，药品利润降低为零，缺口主要通过政府拨款和医保补助来解决。但实际上，多数地区政府拨款和医保补助的数额远远不足，医保补助常需要医院反复交涉才能获得。2010年《建立健全基层医疗卫生机构补偿机制的意见》针对此情形，提出调整技术服务价格水平、设立一般诊疗费、实施绩效工资、政府兜底的要求。

    但事实上，各地一般诊疗费设置水平往往偏低，绩效工资拉开的差距比起改革前的实际分配差距要小得多，政府兜底本身也是个富有弹性的说法，基层机构的收入和人员积极性普遍下降 ......