1同源DNA序列的菌种鉴定鉴定

    DNA测序技术伴随分子生物学技术的快速进步而日臻完善，已成为鉴定菌种的“主流技术”。其依据不同种NTM的DNA同源性片段的特异性将该分枝杆菌鉴定至种或亚种水平，分辨力较高，同时鉴定时间短。菌种鉴定的DNA序列既要满足种内高度保守，种间也要存在一定程度的序列差异。菌种与菌种之间的DNA序列差异越大则鉴别能力越强，而为了减少对鉴定结果的干扰，种内DNA序列差异越小则保守程度越高。

    1.1 16S核糖体DNA(16S ribosomal DNA，16S rDNA)

    16S rDNA是细菌DNA序列，可编码染色体上16S rRNA相对应的序列，是所有细菌染色体基因的固有序列，可用于菌种的鉴定。16S rDNA的序列由可變区(variable region)和恒定区(constant region)组成，恒定区体现物种间的亲缘关系，可变区则呈现物种间的差异程度。16S rDNA种类少，含量大，分子大小适中，既能体现不同菌属间的差异，又可通过测序技术较容易测出其序列 ......