先天性白内障一患病家系的突变基因筛查(2)
1.2.2设计候选基因特异性引物 依据已报道的先天性白内障突变基因的筛查情况,本研究选取以往研究关注的热点致病基因及设计的引物序列[10],所设计的引物覆盖热点基因的全部外显子区。1.2.3 聚合酶链式反应(PCR)测序分析 按SYBRR Green PCR Master Mix(TakaRa生物工程公司提供)试剂盒制备实时定量PCR的反应体系,将合格有效的产物送到上海英骏生物技术有限公司进行纯化及DNA序列测定。测序结果使用在线blast软件进行分析,与美国国立生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)数据库发布的基因碱基序列(参考基因组:NG_016242.1;转录本mRNA序列版本号NM_005267.4)进行比对,以寻找碱基序列的改变。并查阅筛查GJA8,c.10T>C在ESP等各大数据库中的频率信息以排除多态位点。每个样本重复并正反向测序3遍,如发现有碱基序列的改变并排除了该碱基是单核苷酸多态性的可能后,再将该位点与其余全部成员进行对比,以确定该碱基序列的改变在该家系中是否与该疾病是共分离的 ......
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