舒建中 李颖慧 蒲雨晴 刘庆灵 张 娟 甘玉立 谢永芳▲

    1.重庆市中医院脑病科，重庆 400021；2.重庆邮电大学生物信息学院，重庆 400065

    葛根为多年生草质藤本植物[1]，内含有葛根素、大豆黄酮苷等丰富的黄酮类化合物，还有蛋白质氨基酸、糖和人体必需的铁、钙、铜、硒等矿物质，药用价值极高[2]。本研究利用网络药理学，期望从成分-靶点-通路进行整体预测，并阐明葛根在体内的作用机制，选取葛根基本成分，结合靶点功能以及通路对蛋白质相互作用(protein-protein interaction，PPI)网络进行聚类，探讨相关显著的作用模块及每个模块的关键基因，并期望构建PPI 网络以及基因本体(gene ontology，GO)功能、京都基因和基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes，KEGG)通路分析，旨在分析其靶点以及信号通路，对葛根成分小分子及其作用靶点的结合潜力进行探究，以明确其与靶点的结合潜力，为最终构建“化合物-靶点-信号通路”网络奠定基础。本研究预期通过对葛根化学成分的网络药理学分析寻找葛根发挥作用的关键成分、靶点及作用通路，探讨其多靶点多通路协同作用机制，期望能为葛根的开发应用奠定基础。

    1 方法

    1.1 化合物成分及靶点分析

    中药系统药理学数据库与分析平台(pharmacology database and analysis platform of traditional Chinese medicine system，TCMSP)数据库收集中草药的组分和分子结构、关键ADME(吸收、分布、代谢和排泄)参数、成分作用靶点等关键信息[3]。通过TCMSP 数据库，查询葛根主要成分，并筛选出口服生物利用度(oral bioavailability，OB)>30、类药性(drug-likeness，DL)>0.18 的小分子，研究其作用方式。获得小分子的Chem ID，在Pubchem 数据库中找到其对应smile 序列，若无对应靶点信息的成分，利用MOE 软件，使用swiss target prediction 网站获得其成分靶点信息[4] ......