王军军 方雪芬 林秋燕

    1.福建省立金山医院检验科，福建福州 350028；2.福建医科大学附属协和医院消化内科，福建福州 350001

    原发性肝癌是全球第六大常见的恶性肿瘤，是肿瘤相关死亡的第三大原因，仅次于肺癌和结直肠癌。原发性肝癌根据病理类型分为肝细胞癌(hepatocellular carcinoma，HCC)、 肝内胆管癌以及混合型， 其中HCC 占75%～85%。肝癌起病隐匿，很多首次确诊的病人往往错过手术切除治疗的最佳时机，建立肝癌早期的诊断模型，对接受早期治疗尤为重要。目前，常用的诊断肝癌血清学标志物敏感度和特异度有限，迫切需要探索诊断效能高、 评估预后价值好的肿瘤标志物。现有药物疗效一般，副作用大，总体的5年生存率低，因此开发新的分子靶向治疗药物与免疫检查点抑制剂药物尤为重要。本研究通过分析癌症基因图谱(the cancer genome atlas，TCGA) 数据库肝癌数据集，寻找有价值的预测肝癌发生的相关基因，为探索新的分子靶向药物提供数据支持，为提高肝癌的诊疗水平提供新的思路。

    1 资料与方法

    1.1 一般资料

    进入TCGA 数据库(https://portal.gdc.cancer.gov/)，点击“Repository”，“file”选择“Transpcriptome profilling、HTSeq FPKM”，“case”下选择“Liver and intrahepatic bile ducts、TCGA LIHC、Adenomas and adenocarcinomas”可筛选出一项424 例肝细胞癌转录组数据集，下载肝癌数据集mRNA 表达信息的RNASeq 数据及相应的临床资料。本研究共纳入397 例组织并分成两组：HCC 组[共347 例，其中男236 例，女111 例；平均年龄(58.67±13.83)岁]与正常癌旁组[共50 例，其中男28 例，女22 例；平均年龄(61.68±16.12)岁]。同时根据已下载肝癌数据集的临床分期资料将HCC 组中的347 例分为4 组：Stage Ⅰ(171 例)、Stage Ⅱ(86例)、StageⅢ(85 例)、Stage Ⅳ(5 例)。纳入标准：根据筛选条件进行限定检索所得的数据。排除标准：临床数据和预后数据缺失病例。

    1.2 方法

    应用R 语言整理肝癌数据集中Ephrin A1～5(EFNA1～5)mRNA 表达量 ......