基于生物信息学分析微小染色体维持蛋白2在头颈部鳞状细胞癌中的表达及意义
数据库,肿瘤,1资料与方法,1MCM2作为差异表达基因(differentiallyexpressedgene,DEG)的鉴定,2UALCAN数据库分析,3TIMER数据库免疫分析,4关键
黄舒婷温 炬江奕恒秦 思1.广东省第二人民医院民航院区门诊部,广东广州 510405;2.广东省第二人民医院皮肤性病科,广东广州 510317
头颈部鳞状细胞癌(head and neck squamous cell carcinoma,HNSCC)是世界上第六大常见癌症类型,每年约有80余万例新增确诊患者,死亡率占所有恶性肿瘤的1%~2%,在我国,每年新增22.5万例,死亡10.3万例。由于HNSCC发病部位特殊,临床特征不明显,往往患者确诊时已处于晚期,而晚期HNSCC常易发生转移。目前,临床上对头颈部肿瘤的诊断主要依靠影像学检查,容易发生漏诊。微小染色体维持蛋白2(minichromosome maintenance protein 2,MCM2)是参与真核细胞DNA复制启始和延长调控的关键蛋白,研究发现其在宫颈癌、前列腺癌、乳腺癌、结肠癌、肝癌等疾病中有重要意义,但在HNSCC中研究甚少。本研究通过生物信息学技术探究MCM2在HNSCC中的表达,为HNSCC的诊断及治疗提供理论依据。
1 资料与方法
1.1 MCM2作为差异表达基因(differentially expressed gene,DEG)的鉴定
运用基因表达公共(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库下载GSE2379和GSE23036数据集,共包含99个HNSCC样本和31个正常样本,并定义|logFC|>1且调整后的P值<0.05的基因为DEG。
1.2 UALCAN数据库分析
运用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas ......
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