双歧杆菌Ⅱ型毒素—抗毒素系统—MazEF的分子进化分析(1)
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【摘要】 目的：对双歧杆菌属编码的Ⅱ类毒素-抗毒素(TA)系统MazEF进行分子进化分析。方法：利用PSI-BLAST在NCBI中搜索获得双歧杆菌编码的MazF分子序列，在NCBI蛋白数据库、核酸数据库分别下载其他菌属基因组编码的MazF蛋白序列和本研究所涉及菌属的16 S rRNA序列，应用Clustal X2和MEGA4软件对MazF做分子进化分析。结果：共搜索到双歧杆菌株染色体编码毒素蛋白MazF 26个。分子进化分析显示：整个双歧杆菌属的MazF保守性不好；MazF与16 S rRNA的共进化仅在个别菌种中发现，大部分MazF的聚类结果与相应菌种16 S rRNA的聚类结果不同。结论：双歧杆菌中的TA系统MazEF可能是通过基因的水平转移整合入基因组中，属于菌株非核心基因组部分。
【关键词】 MazEF； 毒素-抗毒素系统； 分子进化； 双歧杆菌
Ⅱ类毒素-抗毒素(TA)系统，最早在1982年于大肠埃希菌的低拷贝质粒中发现。其后发现，TA系统同样存在于细菌染色体上，也存在于一些外源DNA岛如噬菌体、转座子、超级内含子和质粒中，由于近年来发现其参与细菌的多种应激调控过程而被广泛关注[1]。生物信息学分析发现：多达750个细菌和古细菌的基因组中存在Ⅱ类TA系统；自生微生物的基因组中一般含有多个Ⅱ类TA系统编码基因，而在严格的胞内微生物基因组中未发现Ⅱ类TA系统编码基因；以上证据提示Ⅱ类TA系统对微生物的生存具有重要作用。主流观点认为：TA系统可能作为一个特殊的压力反应原件，在细菌对不利环境的应激调控过程中发挥重要作用[2-3] ......
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