肺痨康与耐异烟肼结核ahpC基因突变关系的研究(3)
2 结果以ahpC基因为查找内容,手工筛选各excel表中snpEff软件完成突变的注释,模型组、肺痨康组、异烟肼组、联合组分别与标准菌株组对比,发现
5个相同的能影响的碱基突变位点,分别为2721562、2723252、2723506、2729058、2729832。5个碱基突变位点其分别对应的碱基突变为C→G、T→G、T→C、A→C、G→C。其中肺痨康组与模型组对比,发现多出一个突变位点2729621,碱基突变为C→A。异烟肼组与模型组比较,发现多出一个突变位点2726141,碱基突变为C→T。发现2729621、2726141这两个突变位点在联合组中均能找到。与标准菌株作序列对比的4个实验组的7个影响ahpC基因的碱基突变位点,与影响基因ahpC相对应的密码子、氨基酸均未发生变化,见表1;这些突变位点的影响基因均不单一,2729058、2729621位点发生错义突变,影响程度中等(MODERATE)。2729058密码子cTg→cGg,氨基酸由亮氨酸变为精氨酸。2729621仅出现在肺痨康组、联合组,密码子Gcc→Tcc,引起氨基酸丙氨酸变为丝氨酸。2721562、2723252、2723506、2729832发生沉默突变,影响小(LOW),不会影响蛋白质的功能和表达 ......
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