基于网络药理学和分子对接研究甘草治疗白癜风的作用机制
羟基,1材料与方法,1甘草中活性成分及其作用靶点的获得,2白癜风相关靶点的获得,3甘草-白癜风Venn图的制作,4甘草主要活性成分-白癜风靶点网络的构建,5甘草-白癜风交集靶点蛋白相互作用(PPI)网络的构
刘浩,张辛芸,杨宇萍,范潇晓,王文琪,梁敬臣,刘永刚*1.北京中医药大学,北京 100029
2.北京三和丽生物科技有限公司,北京 100068
白癜风是一种常见的色素脱失性皮肤病,患病率为全球人口的0.5%~2%,临床表现为头面部、颈部、手、足等部位出现白斑[1-3]。白癜风的发病机制尚不明确,中医学认为,白癜风属于“白驳风”“斑驳”“白癜”等范畴,风邪相搏、气血失和、脉络瘀阻为此病的病因病机[4-5]。现代医学认为白癜风的发病机制主要集中在自身免疫学说、黑色素细胞凋亡学说、氧化应激学说、遗传与环境因素学说等方面[4,6-8]。
甘草为豆科植物甘草Glycyrrhiza uralensisFisch.、胀果甘草G.inflataBat.或光果甘草G.glabraL.的干燥根和根茎,具有补中益气、缓急止痛、清热解毒、化痰止咳、调和药性等诸多功效[9]。甘草中主要含有三萜类、黄酮类等多种化学成分,其中,甘草酸苷作为甘草中的重要活性成分,具有活化T细胞和自然杀伤细胞(NK 细胞),促进T 淋巴细胞分化,诱导γ-干扰素产生,从而直接减少黑素细胞的损伤,恢复黑素细胞的功能[10]。因此,临床上常使用复方甘草酸苷片对白癜风进行治疗[11-12]。
为了分析甘草治疗白癜风的物质基础和作用机制,本研究基于网络药理学的相关方法[13],系统分析甘草治疗白癜风的主要活性成分、核心靶点以及通路,以期为后续研究提供参考。
1 材料与方法
1.1 甘草中活性成分及其作用靶点的获得
使用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP,http://tcmspw.com/tcmsp.php/),设置筛选条件为化合物的口服生物利用度(OB)≥30%、类药性(DL)≥0.18[14],检索得到甘草中的活性成分。使用PubChem 数据库(https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/)获取活性成分的“Canonical SMILES”,将其输入SwissTargetPrediction 数据库(http://www.swiss targetprediction.ch/)预测得到各个活性成分的靶点蛋白名称,即为甘草中活性成分的作用靶点。
1.2 白癜风相关靶点的获得
使用OMIM 数据库(https://www.omim.org)和GeneCards 数据库(https://www.genecards.org/),以“vitiligo”为关键词检索获取白癜风的相关靶点 ......
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