基于网络药理学及实验验证探讨去甲汉黄芩素促进口腔鳞状细胞癌细胞凋亡的作用机制
货号,1资料与方法,1去甲汉黄芩素靶点基因的筛选,2口腔鳞状细胞癌靶点基因的获取,3“成分-靶点-疾病”网络的构建和拓扑属性分析,4基因表达谱交互分析(GEPIA),5基因本体(GO
郑华艳宁波市鄞州儿童口腔医院 口腔科,浙江 宁波 315199
口腔鳞状细胞癌是最常见的头颈部癌症之一,在全球范围内普遍存在,严重威胁人类健康[1]。现阶段较为明确的口腔鳞状细胞癌致病诱因是吸烟、人乳头瘤病毒(HPV)以及鼻烟等;同时,饮酒被认为是口腔鳞状细胞癌的独立危险因素之一[2]。目前,关于口腔鳞状细胞癌的治疗依然以联合治疗为主,即手术、化疗、放疗以及免疫治疗等[3]。尽管有许多不同的化疗方案和分子靶向治疗的不断的被尝试,但口腔鳞状细胞癌的总体5 年生存率仅保持在50%~60%[4]。虽然,对于不能接受手术切除的口腔鳞状细胞癌患者,放化疗以及免疫治疗可能使其生存期延长约15%,但在应用该治疗方案时会出现多种不良反应以及耐药性[5]。因此,非常需要有效的治疗口腔鳞状细胞癌药物。
去甲汉黄芩素是从黄芩Scutellaria baicalensisGeorgi 的根中分离出具有药理活性的黄酮[6]。黄芩是一种用于治疗流感和癌症的传统中草药。但由于去甲汉黄芩素在天然植物中含量较低,其生物学活性的研究报道有限[7]。随着对其生物学作用进行深入探究,发现去甲汉黄芩素具有抗氧化和抗缺氧的作用。同时,去甲汉黄芩素具有的多种生物学活性逐渐被报道。Wang 等[8]报道,去甲汉黄芩素通过线粒体介导的凋亡、自噬诱导和G2/M 周期阻滞抑制人结肠癌细胞生长。Jing 等[9]发现去甲汉黄芩素减轻缺氧诱导的PC12 细胞氧化应激和凋亡。然而,现阶段关于去甲汉黄芩素在口腔鳞状细胞癌中的作用以及潜在作用机制尚未明确。
1 资料与方法
1.1 去甲汉黄芩素靶点基因的筛选
将“去甲汉黄芩素”导入PubChem 网站获取SMILE 结构,将该结构通过Swiss 数据库(http://www.swisstargetprediction.ch/)、SuperPred 数据库(https://prediction.charite.de/index.php)分别预测去甲汉黄芩素的潜在作用靶点基因。
1.2 口腔鳞状细胞癌靶点基因的获取
在GeneCards 数据库(https://www.genecards.org/)和OMIM 数据库(https://omim.org/)选择关键词“oral squamous cell carcinoma”筛选口腔鳞状细胞癌的相关靶点。
1.3 “成分-靶点-疾病”网络的构建和拓扑属性分析
将去甲汉黄芩素和口腔鳞状细胞癌的共同靶点导入String 平台(https://string-db.org/)构建“成分-靶点-疾病”的蛋白质相互作用(PPI)网络 ......
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