肺腺癌中SPG20基因甲基化检测及临床意义
阳性细胞,1资料与方法,1标本来源,2主要试剂和仪器,3实验方法,4统计学方法,2结果,1肺腺癌和正常肺组织中SPG20甲基化水平比较,2肺腺癌和正常肺组织中SPG20mRNA表达量比较,3肺腺癌和正常肺组织中SPG
赵宝山,孙光蕊,邢志君,张志民,张 旭,梁宗英(承德医学院附属医院胸外科,承德 067000)
肺腺癌是全世界范围内最常见的恶性肿瘤,且发病年龄的年轻化趋势愈加明显[1]。肺腺癌具有放化疗不敏感、血行转移早的特点,致使患者的总体预后不佳[2-3]。因此,提高肺腺癌的早期诊断率、发现评估预后的新指标和新靶点是肺腺癌治疗的重中之重[4-5]。痉挛性截瘫20(SPG20)是发现于肌肉截瘫中的基因,其编码的蛋白在细胞分裂周期的异常作用与肿瘤的发生具有相关性[6];研究[7-9]表明,SPG20甲基化与结直肠癌、肝癌和胃癌之间存在密切关系,并作为早期事件。目前对于SPG20基因在肺腺癌组织内甲基化修饰的研究未见报道。本研究通过检测肺腺癌组织内SPG20甲基化水平,探讨其甲基化与肺腺癌发生和发展的相关性。
1 资料与方法
1.1 标本来源
选取2018年2月至2019年8月承德医学院附属医院胸外科进行手术治疗的70例原发肺腺癌患者。其中男性27例,女性43例;≥60岁者38例,<60岁者32例;吸烟患者22例,不吸烟患者48例;按照IASLC第八版制定的标准进行TNM分期[3]:Ⅰ期23例,Ⅱ期32例,Ⅲ期15例;组织学分级:高分化4例,中分化58例,低分化8例;有淋巴结转移11例,无淋巴结转移59例。实验组:70例肺腺癌组织;对照组:70例正常肺组织(距癌组织>6 cm,经术后病理鉴定)。
1.2 主要试剂和仪器
甲基化修饰试剂盒(德国QIAGEN公司);焦磷酸测序试剂(CST公司);DNA提取试剂盒(北京全式金生物技术股份有限公司);Wizard Cleanup DNA纯化回收系统(美国Sigma公司)、2×SYBR qPCR Master Mix(美国Promega公司)、PCR扩增仪(美国MJ Research公司)、Real-time PCR仪(MX3000P)(美国Startagene公司)。
1.3 实验方法
1.3.1 DNA提取 取肺腺癌组织及癌旁组织标本100 mg,按照基因组DNA提取试剂盒说明和步骤分别提取DNA,并采用紫外分光光度计检测提取的DNA含量和纯度。提取后-20℃保存DNA。
1.3.2 亚硫酸氢钠处理 取纯化的DNA样品20μL,以DNA重亚硫酸盐转化试剂盒对组织和血清样本DNA进行亚硫酸盐修饰。将DNA置于95℃水浴中加热20 min,再冰浴20 min,置于42℃、浓度为3 mol·L-1的NaOH溶液中温浴20 min ......
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