霍乱弧菌分子分型技术研究进展(2)
2. MLSTMIST在监测全球的流行病上具有强大的优势，数据重复性好，可在互联网上共享。基本步骤：选定目的基因组的数个看家基因位点，扩增各目的看家基因片段，扩增产物纯化后测定各位点片段的DNA序列，给各基因位点指定相应的等位基因数值，根据菌株每个管家基因位点指定相应的等位基因数值，根据菌株每个管家基因的序列信息分配等位基因序号(allele number)，把该菌株所有管家基因的等位基因序号合并在一起组成1个等位基因谱(Allelic profile)，并给这个等位基因谱分配1个唯一的编号作为该分离株的序列型(sequence types， STs)。屠丽红[7]用多位点序列分析(MLST)方法对霍乱弧菌的七个管家基因(cat， dnaE， lap， rstR， recA， gyrB， chi)进行扩增、测序、比较，对霍乱弧菌的七个管家基因编号，并根据管家基因的不同组合对霍乱弧菌进行ST分型(sequence typing)，用BioNumerics软件分析。MLST分型显示不同年代的霍乱弧菌产毒株亲缘关系相近，菌群结构比较集中，非产毒株基因组差异大。
3. PAPD
RAPD技术由美国科学家Wiliams和Welsh[8]于1990年分别提出 ......
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