中国H5N1流感病毒神经氨酸酶的进化分析
【摘要】目的研究新型甲型H5N1流感病毒神经氨酰酶的进化规律。 方法采用MEGA软件对H5N1神经氨酸酶氨基酸序列进行种系发生树的构建及序列同源性的分析。结果 发现地域对流感病毒的进化有直接影响。同源比对显示神经氨酰酶存在部分高变位点。 结论为基于受体的抗流感药物设计提供理论基础。【关键词】流感病毒;神经氨酸酶(NA);种系发生树;进化
引言
流行性感冒病毒简称流感病毒,是造成人类及动物患流行性感冒的RNA病毒。流感病毒的主要抗原是HA和NA两类活性蛋白质。NA和HA两种抗原氨基酸序列的突变能直接导致流感病毒的变异[1] 。研究表明HA抗原复杂多变,所以以NA为靶点设计新的抗流感药物已经成为现代药物设计的主流[2] 。因此,本研究通过研究流感病毒中NA蛋白在中国的进化与关键位点的变化情况,为以后抗流感新药设计提供理论支持。
1材料与方法
1.1病毒序列来源研究中所用的序列来源于美国生物信息中心NCBI(http://www.ncbi.nlm.nih.gov) ......
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