非小细胞肺癌血清MGMT、RASSF2、RUNX3及RASSF1A基因启动子CpG岛甲基化的联合检测及意义(3)
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参见附件。
1.4.2 RUNX3的引物设计及PCR反应体系 参照文献[6]设计RUNX3引物,分别识别甲基化特异性(M)和非甲基化特异性序列(U)。RUNX3引物具体序列为:M正义引物:5'-GCGGTAAGATGGGCGAGAATA-3',M反义引物:5'-CACGAACTCGCCTACGTAATC-3';扩增产物大小234 bp。U正义引物:5'- TGGTAAGATGGGTGAGAATA3',U反义引物:5'-CACAAACTCACCTACATAATCC-3';扩增产物大小234 bp。
PCR反应体系20 μL,其中去离子水14.95 μL,10×PCR缓冲液 2 μL,MgCl2(25 mmol/L)1.2 μL,dNTPs (10 mmol/L)0.25 μL,上下游引物各0.2 μL(25 pmol),修饰后的DNA模板1 μL,Taq DNA聚合酶(10 U/μL)0.2 μL,充分混匀后置DNA扩增仪中扩增。反应条件为:95℃预变性5 min,95℃变性30 sec,M引物60℃退火40 sec,U引物56℃退火30 sec,72℃延伸30 sec,共55个循环,最后72℃延伸5 min[7]。
1.5 统计学方法
统计学分析在SPSS13.0版软件包上完成,定量资料采用t检验,分类资料采用x2检验或Fisher精确概率法检验,多个率的比较用方差分析,P<0.05为差异有统计学意义。
2 结果
2.1 MGMT基因启动子区甲基化率
62例NSCLC患者中 ......
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