肺癌细胞中SOX1调控ECT2的表达(2)
1.5 Realtime-PCR检测ECT2表达情况培养A-1细胞至对数生长期,转染p-CMV-SOX1或SOX1 siRNA,转染24h后Trizol 法提取总RNA,逆转录获得cDNA。Realtime-PCR检测ECT2表达情况,以GAPDH为内参进行结果校正。引物序列参见表1。
1.6 染色体免疫共沉淀
培养A-1细胞至对数生长期,转染p-CMV-SOX1,按照ChIP试剂盒抽提DNA,所需抗体分别加入SOX1抗体及IgG抗体为阴性对照,收集DNA。未加抗体组设为Input。从NCBI数据库中查出ECT2基因5’端-1000bp至+100bp序列(转录起始点为0),设计5对引物(图3A),用上述5对引物通过Realtime-PCR检测每个样本Ct值,靶序列的Ct值=2(Ct of Ip’ed DNA-Ct of input)。
1.7 荧光素酶报告法
根据ChIP实验结果设计引物 ......
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