基于网络药理学探讨知母皂苷A-Ⅲ抗鼻咽癌的作用机制
网络图,1资料与方法,1知母皂苷A-Ⅲ的靶点预测,2NPC相关疾病靶点的获取和交集靶点的确定,3知母皂苷A-Ⅲ与NPC相关靶点的蛋白互作网络构建,4GO(基因本体)和KEGG(京都基因与基因组百科全书)相关靶
成南南 徐 宁 杨萌哲 白先愚 郭兴喆 杨建宇 吕安乔 黄元姣,▲1.广西医科大学生物分子医学研究实验室,广西南宁 530021;2.广西医科大学生命科学研究院,广西南宁 530021
鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma,NPC)是我国高发的头颈部恶性肿瘤之一,其发病率和死亡率均高于全球平均水平[1],研究发现中药治疗NPC可起到缓解症状、减毒增效和提高患者生存质量的作用[2]。中药知母具有抗菌、抗肿瘤、解热和抗炎等多种药理活性[3],知母皂苷A-Ⅲ是其药理活性最主要的成分。近年来,研究发现知母皂苷A-Ⅲ对多种肿瘤细胞均有良好的抑制作用[4-5],推测其为良好的抗癌中药,但目前对NPC尚未有研究。因此,本研究借助网络药理学,深入挖掘知母皂苷A-Ⅲ抗NPC的潜在靶点和作用机制,以期为知母皂苷A-Ⅲ的进一步研究提供方向,为临床用药提供循证依据。
1 资料与方法
1.1 知母皂苷A-Ⅲ的靶点预测
通过Swiss Target Prediction数据库获取知母皂苷A-Ⅲ靶点蛋白,并消除重复和不规范的命名,标准化命名。
1.2 NPC相关疾病靶点的获取和交集靶点的确定
利用GeneCards数据库检索NPC疾病相关基因,通过Venny平台将知母皂苷A-Ⅲ的预测靶点与NPC的相关疾病靶点相互映射取交集,获得知母皂苷A-Ⅲ抗NPC作用靶点。
1.3 知母皂苷A-Ⅲ与NPC相关靶点的蛋白互作网络构建
将Venny图获取的交集靶点输入STRING数据库进行可视化分析,最终获得知母皂苷A-Ⅲ与NPC相关靶点蛋白质相互作用网络图 ......
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