小鼠肌球蛋白轻链激酶生物信息学分析
磷酸化,结构域,氨基酸,1材料与方法,2结果与分析,1MYLK基因编码产物及理化性质分析,2MYLK信号肽分析,3MYLK蛋白跨膜结构预测分析,4MYLK蛋白二级结构预测,5MYLK蛋白三级结构预测,6MYLK蛋白结构域预测
边艳超 张传领 张 浩 王万伦 张 婷 刘桐佳 刘 爽 邢凯佳 肖 瑞▲1.内蒙古医科大学内蒙古自治区分子病理学重点实验室,内蒙古 呼和浩特 010059;
2.内蒙古医科大学药学院,内蒙古 呼和浩特 010059
肌球蛋白轻链激酶(myosin light chain kianse,MYLK)主要由平滑肌型肌球蛋白轻链激酶和非肌肉肌球蛋白轻链激酶构成,是生物过程重要参与者[1]。MYLK 是一种钙调素依赖酶,使肌球蛋白得以激活肌球蛋白ATP 酶,通过内皮细胞骨架重塑,促进肌球蛋白驱动收缩、应力纤维形成、黏附、细胞迁移和细胞增殖[2-4]。有研究发现,MYLK 蛋白与精子运动性有紧密的关系,Ashizawa[5]在脱膜精子内加入MYLK 特异性抑制剂,脱膜精子在30℃下的运动性明显被抑制;还有研究发现,MYLK1 对囊胚的形成及雌性生育力的维持是必不可少的[6-7],由此可见,MYLK 在改善雄性生育力问题上可能起着重要的作用。鉴于MYLK 的重要作用,本研究借助生物信息学方法对MYLK 基因的结构以及编码蛋白质的结构和功能等方面进行预测,为进一步研究MYLK 蛋白的功能调节机制奠定理论基础,更有利于了解其影响人类生育力的生物学作用。
1 材料与方法
采用美国国家生物信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI) 查 找 小 鼠MYLK 基因序列,获得MYLK 基因全长编码区序列,对其基因编码的产物及理化性质、信号肽、跨膜结构、二级结构、三级结构、功能结构域、亚细胞定位、磷酸化位点及蛋白质互相作用网络等进行生物信息学分析与预测 ......
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