基于网络药理学技术探究红花治疗关节炎的潜在机制
槲皮素,靶点,1材料与方法,1红花活性成分及靶标蛋白的筛选,2关节炎相关靶点的筛选,3靶点网络构建,4蛋白质相互作用网络(protein-proteininteractionnetworks,PPI)的构建和核心
张玮杰郑州大学第五附属医院药学部,河南郑州 450052
关节炎是多因素共同作用后引起的炎性疾病,其临床表现及诊治时长都给患者的日常生活带来诸多不便。菊科植物红花具有止痛散肿,活血润燥的功效。临床上多用于跌扑损伤、疮疡肿痛等。诸多含红花成分的中成药在老年人风湿骨痛治疗方面发挥重要作用,如红花油、红花如意丸等。因此,红花在治疗关节炎方面具有较高的应用前景。网络药理学作为一门新兴学科,可以从生物网络平衡角度,解释疾病的发生发展,为指导新药的研发提供诸多便利[1]。另外,网络药理学整体性、系统性的特点与中医整体观、辨证论治原则十分契合[2],这为探究中药的作用机制提供更好的思路和方法。基于此,本研究运用网络药理学技术,对红花治疗关节炎的机制进行探究。
1 材料与方法
1.1 红花活性成分及靶标蛋白的筛选
在中药系统药理学分析平台TCMSP(http://tcmspw.com)检索红花的活性成分及对应靶点。活性成分的筛选标准是口服生物利用度(oral bioavailability,OB)≥ 30% 和 类 药 性(drug like,DL)≥0.18。靶标蛋白和基因信息通过Uniprot(https: //www.uniprot.org/)数据库作标准化校正。
1.2 关节炎相关靶点的筛选
通过 GeneCards(https: //www.genecards.org/)数据库获取疾病的相关基因,并以“arthritis”为检索词语,进行检索和筛选。
1.3 靶点网络构建
运用Cytoscape 3.7.2进行“药物-成分-疾病-靶点”的网络构建,进行中心性分析。
1.4 蛋白质相互作用网络(protein-protein interaction networks ......
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