基于TCGA数据库分析甲状腺癌微环境中免疫细胞组分及免疫调节因子变化
意义,1资料与方法,1数据来源,2统计学分析,2结果,1样本的临床特征,2THCA中的非特异性免疫细胞浸润变化,3THCA中的特异性免疫细胞浸润变化,4THCA中的免疫调节因子表达水平,5免
何 魏 程 岳 张 勐 占天鹏 周剑辉 陶 燕 李兰兰 卢建中 付生军 张 静 刘善辉▲1.兰州大学第二临床医学院,甘肃兰州 730000;2.新疆石河子市人民医院呼吸内分泌科,新疆石河子 832061;3.兰州大学第二医院泌尿外科研究所,甘肃兰州 730000
甲状腺癌(thyroid cancer,THCA)是内分泌系统中最常见的恶性肿瘤之一。THCA的发病率在过去几十年中一直在不断增长[1]。虽然通过传统干预措施治疗后,THCA患者病死率有所降低[2-3],但传统疗法治疗后患者通常预后不良[4]。近年调节肿瘤免疫的相关治疗取得了重要进展[5-6]。肿瘤微环境中免疫组分同肿瘤预后密切相关[7-8],有研究表明巨噬细胞靶向治疗可用于浸润性THCA,尤其是肿瘤相关巨噬细胞(tumor-associated macrophage,TAM)含量高的THCA[9]。尽管免疫调节因子抑制剂及单抗已经在临床中应用于治疗多种癌症[10],但对于免疫调节同THCA的相关性尚无系统研究。本研究使用TCGA数据库中THCA患者的基因表达谱数据和临床信息,利用多种生物信息学方法分析22种免疫细胞组分和重要免疫因子在THCA和癌旁组织中的变化。现报道如下。
1 资料与方法
1.1 数据来源
2019年10月20日本研究从TCGA数据库中下载THCA旁和癌组织的相关表达谱数据及患者临床信息。计算癌旁和癌组织中22种免疫细胞含量[11];比较各免疫细胞在癌旁和癌组织中含量差异及其与预后的关系 ......
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