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编号:112184
宏基因组二代测序技术对疑似中枢神经系统感染性疾病的病原诊断价值
http://www.100md.com 2023年6月8日 中国医药科学 2023年第10期
脑炎,病原体,符合率,1资料与方法,1一般资料,2方法,3观察指标及评价标准,4主要仪器及设备,5统计学方法,2结果,2血常规,病毒五项,呼吸道病原体联检,脑脊液检测,头颅影像学检查结果,3宏基因
     林 霞 颉满珍 王根绪 张庆华 赵傲楠

    1.甘肃省天水市第一人民医院神经内一科,甘肃天水 741000;2.上海交通大学医学院附属瑞金医院神经内科,上海 200025

    中枢神经系统感染性疾病是病原微生物侵犯中枢神经系统的脑实质、被膜及血管等引起的急性或慢性炎性疾病,因高发病率和病死率已成为神经内科的重点关注疾病。传统的脑脊液培养可以识别30%~40%的中枢神经系统感染(包括脑膜炎和脑炎)的病原体[1],不能满足临床需要,患者无法得到早期诊断及精准用药。2017 年,宏基因二代测序被法国“成人感染性脑炎管理指南”推荐为1 级证据,以协助中枢神经系统感染的临床决策[2]。文献[3]报道显示宏基因二代测序可提高中枢神经系统感染病原体的诊断率,但其阳性率仅22%。本研究旨在探究宏基因二代测序在疑似中枢神经系统感染性疾病中的病原诊断价值,阐明其在中枢神经系统感染性疾病中的临床优化。

    1 资料与方法

    1.1 一般资料

    回顾性收集2020 年7 月至2021 年12 月就诊于天水市第一人民医院神经内一科40 例疑似中枢神经系统感染患者,其中,男23 例,女17 例,年龄15 ~74 岁,平均(50.33±16.28)岁。患者及家属均知情并且同意配合本研究进行的随访调研工作。本研究通过天水市第一人民医院医学伦理委员会批准。

    纳入标准[4-6]:①急性、亚急性或慢性起病;②有上呼吸道感染的前驱症状或腹泻等感染症状;③神经功能缺损症状,脑膜刺激征、精神行为异常、认知功能下降、癫痫、意识障碍、言语障碍、肢体瘫痪等;④神经影像学提示脑炎、脑膜炎;⑤入院前未接受治疗。排除标准:其他系统感染性疾病。

    1.2 方法

    全部入组患者行血常规、病毒五项、呼吸道病原体联检。脑脊液常规与生化、脑脊液抗酸染色与墨汁染色、脑脊液结核DNA 与单纯疱疹病毒DNA检测、头颅MRI 检查。无菌采集脑脊液样本5 ml于无菌管内,全程干冰运输,-20℃保存,外送至予果生物科技有限公司(西咸新区予果微码生物科技有限公司)进行宏基因二代测序。运用PACEseq病原微生物高通量基因检测,是基于IIUmina 平台的宏基因组测序技术,检测样本中的全部核酸序列,并与微生物基因组数据库进行比对和分析 ......

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