基于网络药理学探讨香附治疗桥本氏病作用机制
靶点,通路,1材料与方法,1软件与数据库,2香附活性成分的筛选及靶点的获取,3HT疾病相关靶基因的获取,4香附与HT的交集靶点,5蛋白相互作用(protein-proteininteraction,PPI)网络构建
李心爱 张旭帆 袁姣姣 商建伟 姚思淼 黄 盛 杨泽佩 王 前 娄文凤马文源 司新颖 耿文倩 祁 烁 丁治国1.北京中医药大学东直门医院甲状腺病科,北京 100700;2.北京中医药大学孙思邈医院甲状腺病科,陕西铜川 727100;3.北京中医药大学孙思邈研究所,陕西铜川 727100
桥本氏病(Hashimoto’s disease,HT)以甲状腺自身特异性自身抗体为特征,尽管已经明确了许多可能引发自身免疫反应的遗传和环境因素[1],但是HT 的确切致病机制仍然未知,HT 的治疗目前侧重于疾病的临床症状。对于其发病机制有待进一步研究。
香附始载于魏晋《名医别录》[2],味甘、微寒、无毒。一名薃,一名候莎,其实名缇。生田野,二月、八月采。”临床多用于肝气郁结月经不调、痛经、胸胁胀痛、乳房胀痛、癥瘕疼痛等[3]。现代研究表明[4],香附对中枢神经系统有一定的影响,有解热镇痛、降温等作用,另外还有雌激素样作用,抑制子宫收缩、抗炎、抗菌、增强活血化瘀功效。临床上用香附治疗HT 的越来越丰富,但是香附治疗本病的作用机制尚未明确,本文应用网络药理学的研究方法构建靶标-通路网络以研究潜在的分子作用机制,为进一步探讨香附治疗HT 的临床应用奠定基础。
1 材料与方法
1.1 软件与数据库
使用的数据库为中药系统药理学数据库与分析平 台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)、GeneCards、人类在线孟德尔遗传数据库(online Mendelian inheritance in man,OMIM)、Uniport、Venn、STRING、靶点数据库(therapeutic target database,TTD)、R 软件及安装包clusterProfiler(x64 version 3.6.1)。
1.2 香附活性成分的筛选及靶点的获取
在TCMSP(https: //old.tcmsp-e.com/tcmsp.php)数据库中查询香附的化学成分 ......
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