短串联重复序列分型检测应用的研究进展
基因座,供者,受者,STR在亲权鉴定中的应用,STR在细胞株的鉴定中的应用,STR在异基因造血干细胞移植中的应用,结语与展望
李 娟,慕 力,李旭婧,史 丽,简小聪(协和干细胞基因工程有限公司 天津 300384)
短串联重复序列(STR)是指重复单位长度为2~6 bp的重复序列,也称为微卫星序列,包括位于中间的核心序列和位于外围的侧翼区,其高度的多态性源于核心序列的重复次数的不同,具有个体特征,在人类全基因组均匀的分布。作为一个重要的遗传标记系统,STR基因座还具有以下特点:(1)重复序列串联排列,多态性好;(2)产物片段在500 bp以下,对DNA质量要求低,易于扩增;(3)灵敏度高;(4)扩增片段相近,扩增条件相似,可进行复合扩增;(5)位点信息明确,可实现标准化和自动化。STR被称作第二代DNA指纹技术,并已广泛用于法医DNA分析、遗传制图、连锁分析、亲权鉴定、细胞株鉴定、个体识别、疾病基因定位、移植后嵌合和物种多态性研究等领域[1]。
荧光标记多重扩增结合毛细管电泳(CE)的分型检测技术是目前STR分型最主要的手段,其分型策略是长度多态性检测,根据微卫星DNA两端序列的保守性,设计一对特异引物,利用PCR技术,将STR基因座扩增出来,得到的PCR产物带有荧光信号在毛细管电泳过程中可以被探测并识别。采集到的荧光信号经过分析比对,转换为基因型数据,最终推算出STR重复单位的重复次数,从而获得位基因分型。
1.STR在亲权鉴定中的应用
STR片段分析具有以下特性:(1)除同卵双生外,每个人包含的DNA序列是独一无二的;(2)同一个个体的各种组织DNA具有相同的序列特征;(3)同一个个体的DNA序列在一生当中保持不变(除某些疾病外);(4)同一个个体的DNA一半来自母亲,一半来自父亲 ......
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