从网络药理学角度研究白芍治疗类风湿关节炎的作用(2)
2.3 生物网络构建 将RA药效物质基础与靶点当作节点,相互作用用边表示。采用Cytoscape软件构建白芍化合物-靶点作用网络[17];在此基础上,若靶点为通路中的蛋白,化合物为该靶点作用的化合物,化合物和通路也当作节点,相互作用用边表示,由此构建白芍化合物-通路作用网络[18]。通过Cytoscape软件中Plugins面板下Network Analysis分析白芍中化合物与靶点、化合物与通路的作用情况。
3 结 果
3.1 白芍治疗RA的分子对接 本实验以p38、JNK-1、JNK-3、PI3Kα、PI3Kβ和PI3Kδ为虚拟药理筛选模型,以蛋白的原配体DOCK-SCORE值为阈值,从白芍中筛选出潜在的活性化合物数目分别为10,2,3,7,19和7,共计25个,见表2。其中,UNPD191674、UNPD167613、UNPD144202、UNPD143034、UNPD13820、UNPD135747、UNPD117238和UNPD101079属于苷类化合物,UNPD99008、UNPD92271、UNPD214940、UNPD212849、UNPD210702和UNPD186304属于有机酸类化合物 ......
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3 结 果
3.1 白芍治疗RA的分子对接 本实验以p38、JNK-1、JNK-3、PI3Kα、PI3Kβ和PI3Kδ为虚拟药理筛选模型,以蛋白的原配体DOCK-SCORE值为阈值,从白芍中筛选出潜在的活性化合物数目分别为10,2,3,7,19和7,共计25个,见表2。其中,UNPD191674、UNPD167613、UNPD144202、UNPD143034、UNPD13820、UNPD135747、UNPD117238和UNPD101079属于苷类化合物,UNPD99008、UNPD92271、UNPD214940、UNPD212849、UNPD210702和UNPD186304属于有机酸类化合物 ......
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