1 材料与设备

    1.1 实验材料 荣筋拈痛方分子数据集；OA的治疗药物。

    1.2 实验设备 本文是在北京大学化学与分子工程学院计算机模拟实验室的计算模拟与数据建模平台Discovery Studio?(简称DS)完成的。计算过程中除非特别说明，所选用的参数均为缺省值。

    2 方 法

    2.1 荣筋拈痛方分子数据集建立 从北京大学中草药有效成分三维结构数据库、中药原植物化学成分手册和文献中[5-8]，共检索出荣筋拈痛方化合物411个。按不同功效分组，即牛膝、当归为补肝肾强筋骨药组，独活、羌活、防风和甘草为祛风湿止痹痛药组。其成分在DS模拟平台上，选用MMFF力场优化，建立荣筋拈痛方中2组的分子数据集。根据DrugBank数据库[8]，搜索到OA的治疗药物31个，其中，刺激关节软骨中蛋白多糖合成的药物3个，抗炎镇痛的药物28个，建立各自的药物分子集。

    2.2 描述符的计算 在DS QSAR模块下，选择1D、2D、3D的描述符48个，分别为碳原子数、氧原子数、氮原子数、总重原子数、分子量、环数目、可旋转键数目、氢键受体数目、氢键给体数目、分子接触体积、分子表面面积、总极性表面面积、总疏水表面面积和脂水分配系数等，计算荣筋拈痛方中补肝肾强筋骨药组、祛风湿止痹痛药组的多维描述符值[3，9]。这些描述符形成的空间定义为化学空间 ......