基于网络药理学探讨四妙丸治疗类风湿关节炎的 作用机制(3)
2.5 四妙丸对RA作用靶点的PPI网络构建结果 根据1.5中要求,STRING 10.5数据库获得14个靶点之间共81条联系的网络图。将图导入Cytoscape 3.6.1软件进行拓扑学分析得出联系其他靶点个数排名前6位的靶点依次是血管内皮生长因子A(VEGFA,13个)、TNF(13个)、IL-6(13个)、JUN(13个)、IL-1B(12个)、PTGS2(12个)。四妙丸对RA作用靶点的PPI网络图见图3。2.6 四妙丸治疗RA预测靶点富集分析结果 把生物过程中前20条目、分子功能和细胞组成的条目绘制成条形图,见图4。
其中生物过程分析得到126个条目,细胞组成分析得到8个条目,分子功能得到5个条目。在生物过程分析中,一氧化氮(NO)生物合成过程的正调节、钙调蛋白1-单加氧酶活性的正调节、发热的正调节、炎症反应、ERK1和ERK2级联的正调节等排位靠前;在细胞组成分析中,主要包括细胞外空间、细胞外区域、质膜外侧等;在分子功能分析中,包括细胞因子活性、生长因子活性、酶结合、内肽酶活性及金属内肽酶活性。KEGG通路富集分析显示共35条通路 ......
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