基于质谱技术分析补骨颗粒对软骨细胞蛋白质组学的影响(3)
3.2 生物信息学分析 基因本论(Gene Ontology,GO)是对生物过程(biological process)、细胞位置(cellular component)和分子功能(molecular function)进行分类。在发生变化的222个蛋白中主要参与生物过程的有13种,其主要为单生物过程(15%)、细胞过程(15%)、生物调节(12%)、代谢过程(10%)及应激反应(9%);细胞位置9个,所占比例较高的前5个是细胞质(27%)、细胞器(23%)、细胞溶质(14%)、细胞膜(13%)及蛋白质复合体(9%);分子功能有8个,其中占比例较高的有离子结合(54%)、激酶活性(25%)、分子活性(6%)、转运活性(5%)与分子功能调节剂(3%)。使用wolfpsort软件对差异表达蛋白进行亚细胞结构的预测和分类发现,细胞质中占34%,胞外基质中占23%,细胞核中占19%,线粒体中占10%,胞膜中占9%。通过KEGG代谢通路分析表明,差异蛋白共参与198个信号转导通路,其中排名前5位的代谢通路为糖酵解通路(5.73%)、碳代谢通路(5.18%)、氨基酸的生物合成通路(4.94%)、淀粉和蔗糖代谢通路(3.96%)、内质网蛋白加工通路(3.46%) ......
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