基于质谱技术分析补骨颗粒对软骨细胞蛋白质组学的影响(1)
基于质谱技术分析补骨颗粒对软骨细胞蛋白质组学的影响,含药血清,细胞凋亡,大鼠
【摘 要】目的:通過定量观察补骨颗粒对大鼠膝关节软骨细胞蛋白质表达的影响,探讨补肾活血中药对软骨细胞的作用机制。方法:将软骨细胞经补骨颗粒含药血清传代培养后通过定量蛋白质组学串联质谱标签标记技术进行检测,使用Maxquant(v1.5.2.8)进行检索。选择UniProt-GOA数据库注释工具对差异蛋白进行基因功能聚类GO分析;采用KEGG在线服务工具KAAS对提交的蛋白进行注释,之后通过KEGG mapper将注释过的蛋白匹配入数据库相应的通路中进行检索分析;使用预测亚细胞定位的软件wolfpsort对所提交的蛋白进行亚细胞定位注释。结果:通过数据库检索,补骨颗粒含药血清及空白血清干预软骨细胞后共鉴定到5028个蛋白质,包含25 423个肽段,其中4297个蛋白质包含定量信息。以1.3倍为变化阈值,t检验中P < 0.05为标准 ......
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