肿瘤坏死因子-α和白细胞介素-17A对骨关节炎患者成纤维样滑膜细胞作用的生物信息学分析(1)
【摘 要】目的:利用生物信息学方法分析肿瘤坏死因子-α(TNF-α)和白细胞介素-17A(IL-17A)对骨关节炎患者成纤维样滑膜细胞的作用机制。方法:从GEO数据库中下载GSE93720基因芯片数据集,利用GEO2R筛选出差异表达基因。用DAVID 6.8在线数据库对差异表达基因进行GO分析和KEGG信号通路分析,String数据库构建蛋白质间相互网络,导入Cytoscape 3.7.1软件进行可视化编辑,筛选出网络中的核心基因,然后用MCODE插件进行子网络模块分析。结果:共筛选出差异表达基因256个,其中上调基因213个,下调基因43个。差异最显著的5个基因是C15orf48、CXCL8、CCL20、CXCL3、CXCR4。上调的差异基因GO分析主要涉及免疫反应、炎症反应、信号转导、细胞因子活性、趋化因子活性等。上调的差异基因KEGG信号通路分析主要涉及细胞因子-细胞因子受体相互作用、肿瘤坏死因子信号通路、趋化因子信号通路等。结论:利用生物信息学方法分析TNF-α和IL-17A诱导的骨关节炎成纤维样滑膜细胞的基因表达谱变化 ......
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