胃肠道间质瘤和其他消化道恶性肿瘤是否存在关联关系，相关报道[14]同时发生GIST和胃肠道的癌病因仍不清楚，虽然GIST同时伴发其他原发肿瘤有确切的症状，例如Carney三联征，1型神经纤维瘤病，但是这些并未提示胃肠间质瘤与消化道癌存在任何联系。目前关于两种非相同起源的肿瘤是否存在联系，有以下几种假设猜想。(1)基因突变；Maiorana[15]等认为基因突变可能导致邻近的两种组织产生交互作用，间皮细胞和上皮细胞生长调控紊乱从而导致在同一器官上两种组织类型不同的肿瘤的发生。Lee FY[16]等认为基因突变可能在两种不同肿瘤的发病机制中起重要作用；但是，缺乏证据支持。Bellone[17]认为包括结直肠癌在内的一些恶性肿瘤中酪氨酸激酶活性的改变与晚期疾病有关。对KIT受体的调节增强了癌细胞迁移的能力，从而启动了转移级联。虽然KIT的激活突变是胃肠道间质瘤的早期事件，但尚不清楚它们是否能作为大肠癌的起始致癌事件[18]。(2)共同或同步致癌物质；曹雪源[19]等人认为可能与共同的致癌因索长期作用胃粘膜，导致干细胞突变有关。Andea[20]也认为一些未知的致癌物同时诱导上皮细胞和间质细胞发生增殖改变 ......