浅析微生物鉴定在污染调查中的应用
质谱,生化,数据库,1生化水平鉴定,2基因水平鉴定,3MALDI-TOF质谱鉴定,4微生物鉴定在污染调查中的应用,5结束语
鲍方名 沈海英(苏州市食品药品检验所,苏州 215004)
浅析微生物鉴定在污染调查中的应用
鲍方名 沈海英
(苏州市食品药品检验所,苏州 215004)
通过对生化水平、基因水平和质谱微生物鉴定系统的分析介绍,比较了不同微生物鉴定系统的优缺点,讨论其在污染调查中的应用。针对生化水平和质谱微生物鉴定系统不能鉴定的微生物,不一定要选择基因水平鉴定,可以选择进行图谱溯源和消毒剂杀灭试验达到清除污染的效果。
微生物;鉴定;污染调查;
按照我国GMP要求,药品生产企业对生产环节的微生物污染需要定期监控。现有的药典和洁净室环境检测要求,通过微生物限度检查、无菌检查、沉降菌监测、浮游菌监测、接触碟和手套等多种手段收集污染微生物,得到量化的数据。而微生物鉴定通过鉴定不同来源的微生物种类,起到溯源调查、从源头控制污染和选择合适的消毒剂的作用[1]。
随着对鉴定效率的不断提高,自动化程度较高的商业化微生物鉴定系统逐步占据市场。法国梅里埃公司的Vitek 2 Compact在2005版药典中被提及。2014年10月,美国Biolog公司GEN III MicroStation型自动微生物鉴定系统在中国食品药品检定研究院化学药品检定所微生物检测室正式投入使用。2013年8月,FDA批准首个质谱仪系统VITEK MS用于鉴定细菌和真菌。微生物鉴定所需时间从小时正式进入分钟计算。但是,这些种类繁多的微生物鉴定系统真正能达到100 %鉴定吗?鉴定出的结果如何能更好的利用于污染调查?本文将介绍不同的微生物鉴定系统及其在污染调查中的应用。
1 生化水平鉴定
目前市场上用的比较多的生化反应鉴定系统有API,Phoenix-100,VITEK 2 Compact和Biolog。从基本原理上,API,Phoenix-100,VITEK 2 Compact系统就是生理生化方法的仪器化操作。通过固定在不同种类检测卡的数十种生化反应底物与待检菌进行反应,将待检菌的生理生化结果与数据库中的结果进行比对,得出相似度在一定数值的鉴定结果。优点是可同时进行多种生理生化测试,不需要人工配制多种生化反应底物;全程机器培养判读,避免经验不足影响人工判读;检测时间缩小到小时级别。而Biolog系统通过检测待测细菌对95种不同碳源的代谢情况,分析细菌的代谢过程,并通过对系统数据库的检索实现对待测纯系菌株的快速鉴定。
通过使用发现,由于还是生理生化反应的结果,不同培养时间的菌落检测结果不一致;不同系统的生化反应由于公司壁垒互有不同 ......
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