吴联朋，夏丹丹，徐克

    1.温州医科大学定理临床学院 温州市中心医院 检验科，浙江 温州 325000；2.温州市新发与再发传染病诊治重点实验室，浙江 温州 325000

    耐药结核病尤其是耐多药结核病(multidrug resistant tuberculosis, MDR-TB)一直是全球公共卫生的主要威胁之一[1]。WHO发布的全球结核病报告显示，2021年全球新发耐药结核病患者数约为45万，其中仅16.1万例接受了治疗，表明近65%的耐药结核病患者未能被及时诊治[2]。耐药结核病的诊断长期依赖于传统表型药敏试验，由于结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis, MTB)生长速度缓慢，表型药敏试验往往需要耗时1～2个月，使得临床医师无法及早诊断[3-4]。随着分子诊断技术的发展，快速诊断耐药结核病已经能够实现，但常见的分子诊断方法(如基因芯片、熔解曲线等)只能检测单个或少数几个基因的突变[5-7]，而全基因组测序(whole genome sequencing, WGS)技术可以同时检测多个基因突变，具有高通量、耗时短等优点[8]，比上述方法更适用于MTB的耐药性检测。随着WGS技术的推广普及，分析WGS在本地区耐药结核病中的诊断效能具有重要意义。本研究采用MGIT960液体法药敏试验及WGS对温州地区的65株MTB菌株进行耐药性检测，以MGIT960液体法药敏试验结果为参考标准，评价WGS在耐药结核病诊断中的应用价值。

    1 材料和方法

    1.1 菌株来源

    收集2021年1月至2022年9月温州市中心医院收治的65例经Gene-xpert MTB/RIF检测和临床诊断为结核病患者的痰液或灌洗液标本进行分枝杆菌培养，其中Gene-xpert MTB/RIF检测利福平耐药的标本54例，利福平敏感的标本11例，共获得65株结核分枝杆菌用于研究分析。以结核分枝杆菌标准菌株H37Rv(ATCC27294)作为对照 ......