CALM2基因多态性与青少年特发性脊柱侧凸遗传易感性的关联性研究*
分型,1材料与方法,1研究对象,2研究方法,3数据统计处理,2结果,1流行病学资料统计处理,2Hardy-Weinberg(H-W)平衡检验,3基于等位基因的“病例-对照”关联分析,4基于基因
周 熹 邱贵兴 吴志宏 原所茂 费 琦 刘 正(中国医学科学院 北京协和医学院 北京协和医院骨科,北京100730)
青少年特发性脊柱侧凸 (adolescent idiopathic scoliosis,AIS)的发病原因及具体机制尚不清楚,多数学者认为其可能是多基因遗传病[1-5]。有文献报道钙调蛋白水平增高和进展性AIS之间有一定关联意义[6-12],也有研究显示钙调蛋白 1基因(CALM1基因)的多态性与AIS不同亚型有一定联系[13]。与 CALM1基因一样,钙调蛋白 2基因(CALM2基因)同样参与钙调蛋白合成表达,本研究选择CALM2基因为考察对象,研究其多态性与AIS的遗传易感性之间的关系,并且对不同基因表型对AIS临床亚型之间的关联性进行了分析探讨。
1 材料与方法
1.1 研究对象
采用“病例-对照”研究方法,研究对象为中国汉族人群,包括散发性青少年特发性脊柱侧凸病例组和正常对照组。病例组来自2005年10月至2008年2月北京协和医院脊柱外科病房住院的中国汉族AIS患者 (Cobb角≥30°),男17例,女90例,年龄范围10~22岁,平均15.53±2.18岁。所有患者通过临床和影像学确诊,排除其它类型的脊柱侧凸。分别记录所有患者PUMC分型[14]资料、侧凸顶点位置以及Cobb角。对照组来自同期北京协和医院就诊的外伤、感染患者及健康查体者,排除脊柱侧凸家族史和病史。对照组男17例,女90例,年龄范围10~20岁,平均15.12±2.59岁。所有研究对象和其家长签署知情同意书,并获得中国协和医科大学临床研究伦理委员会批准。
1.2 研究方法
1.2.1 SNP(single nucleotide polymorphyism,单核苷酸多态性)位点选择 在美国NCBI-SNPs数据库(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP)和欧洲Ensembl-SNPs数据库 (http://www.ensembl.org/index.html)中,查找 CALM2基因的已知SNPs。根据国际人类基因组单体型图计划 (http://www.Hapmap.org)提供的基因型数据,优先选取杂合度高于10%,位于外显子区域或有错义突变的SNPs和位于3'-、5'-调控区的SNPs作为遗传标记,共选取8个SNPs,具体见表1。 ......
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