三甲医院特别是大学附属医院，肩负着医疗、教学和科研的繁重任务，科研经费所占比例相当可观，且项目繁多，资金来源呈多元化。根据来源渠道不同，科研经费分为横向经费和纵向经费。来源于企事业单位、社会团体的科研经费即横向经费。横向经费属于应税业务，是医院缴纳增值税的主要项目。财政体系拨入的科研经费为纵向经费，属于非应税业务。科研经费横纵交织、错综复杂。营改增对医院科研经费的管理影响较大。对于科研应税项目进项税抵扣管理，建议采用应税项目综合抵扣与单一项目抵扣相结合的管理方式。在应交增值税明细科目下设置项目明细账，登记各项目纳税明细。营改增后，横向科研经费缴纳增值税，税率从营业税的5%上升为6%，能否及时足额取得可抵扣进项税，直接影响到科研项目成本。横向科研经费的进项税抵扣是按单一项目抵扣，还是所有项目混合抵扣，两种方法各有利弊。按单一项目抵扣管理权责清晰，但核算繁琐，不利于医院整体税负水平的调节；按所有项目混合抵扣管理省时省力，有利于医院整体税控调节和可抵扣进项税的统筹使用，但容易产生“大锅饭”现象，不利于调动科研人员积极性和科研项目成本核算。医院需根据自身情况，选择适合的管理方式。

    3 加强票据管理 ......