基于分子对接对唐古红景天中抑制精氨酸酶活性成分的研究※
氢键,材料与方法,1主要材料与仪器,2分子对接方法,3精氨酸酶抑制活性,4精氨酸酶抑制动力学,结果,1分子对接,2没食子酸抑制精氨酸酶活性测定,3精氨酸酶抑制动力学测定,讨论
王 珊,华玉美多,苏姗姗,南星梅,杨占婷,芦殿香,李占强*[1.青海大学生态环境工程学院,青海 西宁 810016;2.青海大学高原医学研究中心,高原医学教育部重点实验室,青海省高原医学应用基础重点实验室(青海-犹他高原医学联合重点实验室),青海 西宁 810001;3.西宁海关技术中心,青海省食品安全研究重点实验室,青海 西宁 810003;4.青海大学医学院药学系,青海 西宁 810001]
精氨酸酶(Arginase,Arg)通过与一氧化氮合酶竞争底物L-精氨酸来调节NO的生物利用度,Arg活性的增加和NO生物利用度的降低会引起内皮功能障碍及其并发症的发生[1,2]。因此,认为Arg是治疗内皮功能障碍性疾病的潜在靶点。课题组前期研究发现,唐古红景天活性部位能够通过调节NO水平而发挥血管舒张活性,并能够显著干预低氧性肺动脉高压的形成[3,4]。基于此,本研究以精氨酸酶与唐古红景天中部分化学成分的分子对接结果为基础,虚拟筛选出抑制精氨酸酶的活性成分。并测定其中没食子酸对精氨酸酶的IC50、Ki、Ki′值,确定其对精氨酸酶的抑制活性及酶动力学反应类型。
1.材料与方法
1.1 主要材料与仪器
精氨酸酶(批号:M20A11Y120133,规格:BR,100μ/mg)购于上海源叶生物科技有限公司,没食子酸(批号:J1120A)购于大连美仑生物技术有限公司),尿素(Lot#:C11167159)、L-精氨酸(Lot#:C10882613)、2-异亚硝基苯丙酮(Lot#:C10239530)、氯化锰(Lot#:C11446505)均购于上海麦克林生化科技有限公司,1M Tris·HCl(产品编号:ST776-100mL)购于碧云天生物技术研究所。全自动酶标仪分析系统(Infinite 200 Pro)购于Tecan公司。
1.2 分子对接方法
1.2.1 结构准备
从PDB数据库(www.pdb.org)获得精氨酸酶蛋白晶体结构(PDB编码:3KV2)。配体分子三维结构从PubChem数据库(https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/)获得 ......
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