STAT3、STAT5A、RUNDC3B候选基因多态性与西藏世居人群高原红细胞增多症的易感性※
基因型,位点,对象与方法,1研究对象,2DNA提取方法,3基因分型方法,4统计学方法,结果,1HWE检验与MAF分布,2遗传模型下SNPs位点与HAPC的关系分析
张 寒,陈 辉,刘丽军,张致英,杨雪林,渠敬锋,马福才,马利锋,康龙丽*(1.西藏民族大学医学部高原相关疾病分子遗传机制与干预研究省级重点实验室,陕西 咸阳 712082;2.西藏民族大学医学部环境与疾病相关基因研究高校重点实验室,陕西 咸阳 712082;3.西藏自治区第二人民医院,西藏 拉萨 850000)
高原人群长期处于高原低压低氧环境,会发生特有的慢性高原病(Chronic mountain sickness,CMS)——高原红细胞增多症(high altitude polycythemia,HAPC)[1]调研发现,同一海拔地区西藏世居人群HAPC发病率显著低于移居汉族人群,且女性患病率(1.9%)低于男性(3.4%)[2]。西藏世居人群可能存在高海拔低氧环境的适应基因,以抵抗HAPC的发生。目前,已有多篇文献认为高原人群HAPC的发病与基因位点的变异有关,包括PPP1R2P1、SENP1、ANP32D、PIK3CD、EPAS1等[3,4,5]。结合现有文献报道和课题组前期小样本测序研究结果[6],筛选出西藏世居人群发生HAPC可能的候选基因STAT3、STAT5A、RUNDC3B。本研究采取目标区域靶向测序技术,探讨STAT3、STAT5A、RUNDC3B候选基因多态性与西藏世居人群HAPC易感性的相关关系,为HAPC的遗传机制研究提供依据。
1.对象与方法
1.1 研究对象
根据“青海标准”[1],选择同一时段在西藏民族大学附属医院及西藏自治区第二人民医院就诊的西藏世居者,并根据性别进行分组研究。纳入及排除标准:①男性Hb≥21 g/dL,女性Hb≥19 g/dL;②长期居住在3 650米以上的高原地区;③排除真性和假性以及其他继发性红细胞增多症。
两所医院共招募927名长期居住于3 650米以上无血缘关系的志愿者,其中HAPC患者567例(男性455例,女性112例),纳入病例组;同期匹配健康对照者360例(男性248例,女性112例),纳入对照组。研究内容符合《赫尔辛基宣言》规定并经西藏民族大学医学部伦理委员会批准。
1.2 DNA提取方法
采集3 mL外周血液样本 ......
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