王 蕾，魏 威，周 培，冯 琳，李润乐，汤 锋

    (1.青海大学高原医学研究中心，青海省高原医学应用基础重点实验室，青海 西宁 810001；2.青海大学研究生院，青海 西宁 810001；3.青海大学基础医学部，青海 西宁 810016)

    研制表位疫苗的关键是要找到优势抗原表位，但如何寻找优势抗原表位是一个难题。生物信息学工具的应用使筛选潜在优势抗原表位成为可能，并且不必承担培育相关病原体的风险。本课题拟通过多房棘球蚴葡萄糖转运蛋白(glucose transporters，GLUT)抗原表位生物信息学预测优势抗原表位。

    GLUT的编码基因是SLC2，属于膜转运蛋白中的易化载体超家族(the major facilitator superfamily，MFS)。已有明确的证据表明，不同的GLUT在调节代谢、基因表达、基因分化和肿瘤发生等方面发挥特定的作用。Cora Delling等[1]发现感染急性期宿主肠道上皮细胞对葡萄糖的吸收发生了适应性变化。Abdul Aziz Qureshi等[2]阐明了疟原虫GLUT影响糖摄入的分子机制。Takuya Kashiide等[3]成功克隆并鉴定了多房棘球蚴的GLUT同源物，获得了2个推测的GLUT基因(EmGLUT1和EmGLUT2)的全长序列；同时发现EmGLUT1是一种简单的易化葡萄糖转运体，可能在多房棘球蚴整个生命周期的葡萄糖摄取过程中起重要作用。由此可以通过蛋白质序列鉴定多房棘球蚴GLUT的优势抗原表位。

    EmGLUT蛋白的二级结构特征通过在线预测软件Self-Optimized Prediction Method with Alignment(SOPMA)得出结果。使用生物信息学软件Immune Epitope Database(IEDB)和Syfpeithi预测EmGLUT潜在的T细胞优势抗原表位，使用生物信息学软件Bcepred和ABCpred预测EmGLUT潜在的B细胞优势抗原表位。

    1 材料与方法

    1.1 获取EmGLUT的氨基酸序列

    从NCBI-Gen Bank中(http：//www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/)[4]获得多房棘球蚴GLUT氨基酸序列和核苷酸序列。

    1.2 预测EmGLUT的二级结构特征

    使用生物信息学软件SOPMA(https：//npsa-prabi.ibcp.fr/cgi-bin/npsa_automat.pl?page=/NPSA/npsa_sopma.html)[5 ......