郝佳星,彭真,邹淑花

    (青岛大学附属青岛市妇女儿童医院,山东 青岛 266034)

    拷贝数变异是后基因组时代被逐渐认识到的肿瘤性疾病特征性改变。人类基因组有众多频率、强度不等的重复序列，而拷贝数变异被定义为涉及范围从1 kb到数Mb不等的基因片段的删除、插入、复制及多位点变异的改变类型[1-2]。目前研究认为，拷贝数变异不仅是个体遗传差异的基础，也在体细胞恶性转化、肿瘤发生、进展及转移定植中发挥着重要作用，拷贝数变异相关指标或可成为理想的肿瘤诊断标志物。磷脂酰肌醇-3激酶(PI3K)/AKT是经典的肿瘤信号转导通路，PI3K/AKT通路的高活化与多种肿瘤凋亡抑制、侵袭转移及促血管生成密切相关，而PI3K是该通路的关键分子[3]。在哺乳动物中编码催化PI3K亚基的8种基因中，只有编码普遍表达的p110α催化亚基的PIK3CA常有高突变率[4]。突变的PIK3CA持续活化，上调PI3K/AKT通路水平进而参与肿瘤发生。既往已有较多关于结直肠癌、乳癌中PIK3CA突变及拷贝数变异的研究报道，而PIK3CA在卵巢癌、宫颈癌等妇科肿瘤中研究并不多见[3]。本文借助癌症基因组图谱(TCGA)数据库，将临床样本数据与RNA-Seq数据相结合，探讨PIK3CA基因拷贝数异常在卵巢癌、宫颈癌中的表型及信号转导机制，以期为卵巢癌及宫颈癌恶性进展机制研究及诊断提供思路[5]。

    1 材料和方法

    1.1 研究对象

    相关数据自TCGA数据库网站中下载获取，检索TCGA数据库中有关宫颈癌及卵巢癌的 Illumina HiSeq_RNA-Seq测序数据并进行打包整理。

    1.2 数据分析

    1.2.1纳入研究样本数量 在TCGA可视化数据库cBioPortal(https://www.cbioportal.org)中选择Ovary/Fallopain Tube→Ovarain Epithelial Tu-mor→Ovarain Serous Adenocarcinoma(TCGA, Pan Cancer Atlas)，共获得了201例符合要求的研究样本；选择Cervix→Cervical Squamous Cell Carcinoma(TCGA, Pan Cancer Atlas),共获得275例符合要求的研究样本 ......