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编号:451138
基于网络药理学探讨黄芪治疗子宫内膜癌的机制
http://www.100md.com 2022年4月29日 青岛大学学报(医学版) 2022年第2期
靶点,通路,1材料和方法,1黄芪成分筛选,2活性成分-靶点网络构建,3EN相关靶点检索,4蛋白质互作(PPI)网络的构建及关键靶点筛选,5生物通路富集分析,2结果,1黄芪活性成分及靶点获取,2黄芪活性成分-靶点网络构
     姜丕雨,李康康,周静祎,王雪莲,程明阳,陈雪红

    (青岛大学基础医学院特种医学系,山东 青岛 266071)

    子宫内膜癌(EN)是发生在子宫内膜的一组上皮性恶性肿瘤,是女性生殖系统常见恶性肿瘤之一,且近几年EN的发病率逐渐上升[1]。EN发病与多种因素有关,目前针对EN治疗以手术为主,辅以放疗和化疗[2]。但化疗药物具有较强的毒副作用,而中药抗肿瘤具有多靶点、多方位以及不易产生耐药性等优点,在临床上已成为肿瘤治疗的重要研究方向[3]。近年来临床上将黄芪应用于多种肿瘤的治疗,效果显著,且有体外细胞实验证明黄芪对EN细胞有较强的抑制作用[4]。本研究应用网络药理学的方法,系统地探究黄芪的有效活性成分、潜在作用靶点以及调控的通路信息,为黄芪治疗EN提供理论依据。现将结果报告如下。

    1 材料和方法

    1.1 黄芪成分筛选

    以“黄芪”为关键词,以口服生物利用度(OB)≥30%、类药性(DL)≥0.18为活性成分筛选条件,检索中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)[5]数据,获得黄芪的有效活性成分。

    1.2 活性成分-靶点网络构建

    使用Uniprot数据库校正与转化功能,将查询到的黄芪活性成分转换成靶蛋白的规范名称。将活性成分-靶点关联信息导入到Cytoscape 3.7.0软件,处理黄芪的活性成分和靶点的相关信息,从而构建出黄芪活性成分-靶点网络图。

    1.3 EN相关靶点检索

    以“endometrial carcinoma”为关键词,检索Genecards数据库[6]、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM数据库)[7]等疾病基因数据库,汇总疾病靶点并去除重复值,得到EN相关作用靶点。

    1.4 蛋白质互作(PPI)网络的构建及关键靶点筛选

    选用Cytoscape 3.7.0软件中的Biogenet插件构建PPI网络 ......

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