miR-1185-5p通过靶向PITPNB抑制鼻咽癌细胞的增殖和迁移
头颈部,鳞状,荧光素酶,1材料与方法,1TCGA数据库检索及PITPNB与miR-1185-5p结合位点的预测,2细胞培养,3质粒构建及转染,4RT-PCR方法检测miR-1185-5p和P
汪若璜,徐冰清,柴芳玉,孔静文,杜晓云,姜彦(青岛大学,山东 青岛 266071 1 医学部; 2 附属医院耳鼻咽喉头颈外科)
鼻咽癌属于高度恶性的头颈部肿瘤,早期诊断困难且缺乏特异性的检测指标[1]。放射治疗是非转移鼻咽癌的主要治疗手段[2],但放射抵抗的出现会引起局部复发以及远处转移,导致治疗失败[3-4]。因此寻找新的治疗靶点以改善病人的预后具有重要的意义。microRNAs(miRNAs)可以通过互补序列与靶标mRNA分子结合从而抑制mRNA的翻译[5]。miRNAs作为遗传调节因子,在鼻咽癌的发生发展中至关重要[6-10]。研究表明,miR-1185-5p在鼻咽癌中存在差异表达,但其作用尚未阐明[11]。磷脂酰肌醇转运蛋白β (PITPNB) 3′-非编码区(UTR)内存在与miR-1185-5p碱基互补配对的序列,推测miR-1185-5p可能对PITPNB具有调控作用。本研究探讨miR-1185-5p对鼻咽癌细胞增殖和迁移的调控作用,并以PITPNB为靶点探讨其下游机制,旨在为鼻咽癌的治疗提供新方向。
1 材料与方法
1.1 TCGA数据库检索及PITPNB与miR-1185-5p结合位点的预测
检索癌症基因组图谱(TCGA)数据库中43组配对的头颈部鳞状细胞癌样本及其癌旁正常样本的转录组数据与临床数据,应用“ggplot2”R包分析其中miR-1185-5p和PITPNB的差异表达,应用“survminer”R包分析PITPNB表达与病人总生存率间的关系;应用TargetScan(http://www.targetscan.org/)预测miR-1185-5p与PITPNB之间的结合位点。
1.2 细胞培养
应用含体积分数0.10胎牛血清(以色列BI公司)的RPMI-1640培养液(大连美仑公司),37 ℃条件下,在含体积分数0.05的CO2培养箱中培养鼻咽癌CNE-2细胞(上海通派公司) ......
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