孕哺期暴露NP对子代大鼠脑组织基因表达谱的影响*
芯片,活性,1材料与方法,2结果,3讨论
许 洁,汪 洋,杨孟雪,蒋智钢,万齐友,庹芳旭,封校亚,俞 捷(1.重庆医科大学 公共卫生学院, 重庆 400016;2. 遵义医学院 公共卫生学院, 贵州 遵义 563099;3. 遵义医学院附属医院 内分泌科,贵州 遵义 563099 )
基因芯片技术是20 世纪 90 年代迅速发展起来的分子生物学技术,它在疾病发生机制和临床诊断等许多生命科学领域已得到广泛的应用,具有快速、准确、多样性、微型化和自动化等优点[1-4]。目前,基因芯片技术在神经毒理学中的应用还属于初始阶段,本研究应用基因芯片技术筛选暴露仔鼠模型海马组织的差异表达基因,拟在基因水平揭示Nonylphnol (NP) 引起仔鼠学习记忆能力降低的可能作用机制。
结合在前期实践过程中遇到的若干问题,遵循对照长江经济带发展和生态文明建设的新要求,本文从顶层设计、系统治理、绿色发展、科技与制度改革创新、水生态文明意识培育五个方面探索提出对城市水生态文明建设的对策建议。
1 材料与方法
1.1 实验动物分组及染毒 选取清洁级Sprague Dawley大鼠性成熟个体,雄鼠15只,雌鼠30只,按雌:雄2:1同笼交配(由第三军医大学实验动物中心提供:SCXK(渝)20070005),获取妊娠雌性SD鼠后随机分为NP组与对照组,于妊娠第6天到出生后21 d灌胃NP和花生油, NP 纯度99%(购于东京化成株试会社)。
1.2.2 差异表达基因的筛选 原始数据用FastQC检测数据质量,使用Tophat进行“序列比对”,再由Cufflink系列软件分析阴性对照组和miR-1254模拟体组的DEG。其中,以倍数变化(fold change,FC)表示单个基因表达变化的倍数。以q<0.05且|log FC|≥1考虑差异有统计学意义。
1.2 样品的合并 NP实验组和对照组21 d仔鼠累积取样各10个,于盛有液态氮的金属溶器中进行样品合并,放液氮罐中备用。
2.3.1.1 分子功能(molecular function)差异表达基因主要涉及的分子功能:结合活性(binding activity)有158个基因上调、催化活性(catalytic activity)有83个基因上调、核酸结合活性(nucleotide binding)有55个基因上调,嘌呤核苷酸结合活性(purine ribonucleotide binding)有50个基因上调等(见图1)。
1.5 差异基因GO(Gene Ontology)分析 GO是基因及基因产物的功能分类体系 ......
您现在查看是摘要页,全文长 9668 字符。