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编号:808637
江苏盐城沿海滩涂湿地放线菌多样性及功能基因的筛选
http://www.100md.com 2019年7月23日 遵义医科大学学报 2019年第3期
1材料与方法,2结果与分析,3讨论
     郑 洁,庹 利,2,李 伟,保玉心,2

    (1.遵义医科大学 研究生院,贵州 遵义 563099;2.遵义医科大学 医学与生物学研究中心 遵义市理化分析测试工程研究中心,贵州 遵义 563099)

    放线菌因其次级代谢产物结构的复杂性和多样性而具有抗感染、抗肿瘤等生物活性[1]。目前在临床上应用的抗生素有3/4是由放线菌生产的[2]。如临床广泛应用的链霉素、阿奇霉素等[3]。随着抗生素的广泛使用,病原菌的耐药性急剧增强,使得现有抗生素越来越不足以应对这种局面,因此迫切需要新型抗生素,以适应病原菌对抗生素敏感性改变的速度[4-6]。放线菌在自然界中分布广泛,近年来,为了获取新的放线菌资源,人们逐渐将目光投向一些特殊环境[7]。沿海滩涂是介于陆地与海洋的生态系统交错区,受到海洋和陆地环境的双重影响,因此滩涂土壤中可能拥有独特的、既不同于陆地也不同于海洋环境的微生物资源[8-9]。有研究表明,滩涂沉积物中培养分离得到的细菌中有20%~30%属于新菌种[10]。在同属黄海区域的朝鲜半岛潮间带沉积物中,Lin等[11]分离到好氧菌株Marinimicrobiumkoreense和Marinimicrobiumagarilyticum;Bruns等[12]在德国北海潮间带沉积物中分离到厌氧菌株Muricaudaruestringensis;Choi等[13]分离到从属于Flavobacteriaceae的菌株Lutibacterlitoralis,这些结果表明滩涂土壤中可能具有独特的微生物资源。江苏盐城沿海滩涂湿地位于我国沿海地区中东部,属于从北亚热带向南暖温带过渡地带,是太平洋西海岸亚洲大陆边缘面积最大、原始生态保持最完好的海岸型天然湿地。目前,关于江苏盐城沿海湿地微生物特别是放线菌研究报道较少,纪元、张小蒙等只对江苏盐城沿海滩涂进行了简单的放线菌菌落计数[14-15]。对该地区放线菌的多样性及抗生素生物合成基因未见报道。本研究从江苏盐城沿海采集滩涂土壤样品,通过纯培养的方法对该地区的放线菌进行分离鉴定、多样性分析及抗生素生物合成基因筛选,以了解该地区放线菌分布特点,同时期待发现放线菌新物种或稀有放线菌,为新抗生素发现提供菌种储备,为进一步开发利用滩涂湿地放线菌资源开发和利用提供科学依据。

    1 材料与方法

    1.1 材料

    1.1.1 土壤样品 2018年2月,围绕盐城市射阳县黄海海域每隔10~20 m设置采样点一个(样品采集地点见表1)。去除土壤表面覆盖的泥沙后,用无菌铲铲取20 cm深度土样后立即放入无菌封口袋中 ......

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