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编号:93220
基于生物信息学方法分析银屑病病理机制中的调节网络
http://www.100md.com 2023年3月2日 遵义医科大学学报 2023年第2期
网络图,差异基因,1资料与方法,2结果,3讨论
     王景乐,徐 曦, 郎广平, 韩盈盈

    (1.遵义医科大学 基础医学院, 贵州 遵义 563099;2.遵义医科大学 口腔医学院 口腔疾病研究特色重点实验室,贵州 遵义 563099;3.遵义医科大学 基础药理教育部重点实验室暨特色民族药教育部国际合作联合实验室,贵州 遵义 563099)

    银屑病是一种慢性皮肤炎症,临床表现为红斑、脱屑及皮肤增厚[1]。病理特征为角质形成细胞的增殖和免疫细胞的浸润[2]。银屑病分为寻常型银屑病、脓疱型银屑病、红皮病型银屑病以及关节病型银屑病[3],主要影响人的皮肤及关节。各年龄段的人都可能受到影响,患病率具有地理性差异,近年来,银屑病的发病率有所增加[4]。由于银屑病的临床症状出现在皮肤表面,患者身体及心理都有着沉重的负担[5]。银屑病患者会出现各种并发症,如:心血管疾病、精神疾病和代谢综合征;研究表明,银屑病的危险因素包括:肥胖、酗酒和吸烟[6]。目前研究发现IL-23和IL-17是银屑病发病机制中的重要因素,IL-23作为发病机制中的上游,可以刺激Th17细胞的增殖分化,促进下游因子IL-17的产生,进而作用于角质形成细胞,内皮细胞等[7-8]。针对银屑病的治疗目前可采用一些生物疗法,如:TNF-α抑制剂、IL-23抑制剂及IL-17抑制剂等[9]。但是,目前的疗法临床安全性差[10],银屑病仍然无法治愈。因此,寻找关键的靶点及特异性的生物标志物对于银屑病的发病机制研究和临床诊断均有重要意义。

    MicroRNA(miRNA)是一种高度保守的小的非编码RNA,可以通过使mRNA翻译受到抑制或通过降解mRNA来调节mRNA的表达[11],作为关键的调节因子,miRNA参与细胞的增殖、分化、凋亡和免疫反应等。如:miR-210在银屑病患者中高表达,促进T细胞分化[12]。因此,miRNA在银屑病发病机制中也有重要的意义[13]。

    转录因子(TF)是一种DNA结合蛋白,通过与DNA序列的特定结合位点进行结合,参与转录调控,这是基因表达调控的关键,在基因表达中发挥着重要作用[14-15]。在银屑病中,STAT3已被证实是银屑病发病机制的重要参与者[16]。本研究拟通过公共数据库GEO中2个银屑病数据集的生物信息学分析,筛选出与2个数据集共同差异表达基因互作的蛋白、miRNA、TF以及最有可能调控银屑病病理机制TF-mRNA-miRNA网络。

    1 资料与方法

    对GEO中的表达谱数据进行差异分析;对差异基因进行富集分析了解差异基因的生物学功能与途径;利用数据库预测差异基因靶向的TF群与miRNA群并构建TF-miRNA-mRNA网络图来识别银屑病相关基因的关键基因、miRNA和TF ......

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